Через семь месяцев после окончания Одногодичной войны остатки Герцогства Зион превратились в Республику Зион и продолжили сражение. Дэрил пилотировал мобильного воина «Психо-Заку» в конце войны в секторе «Удар молнии», где был уничтожен флот Братства Мур. После потери «Психо-Заку» Дэрил отправляется на Землю для получения информации об Альянсе Южных морей, военной группы в составе Земной Федерации. Ио, который противостоял Дэрилу, был выбран для пилотирования прототипа мобильного воина «Атлас...

Годовая война. Войска Земной Федерации и Зеона сражаются в секторе Тандерболт. Этот участок космоса известен наличием постоянных электрических разрядов. Пилот Федерации Ио Флеминг возглавляет атаку против аса Зеона Дэрила Лоренца и его отряда снайперов. Вскоре к Флемингу попадает прототип Гандама, что может стать ключом к победе....